治疗滴虫病的特效药是灭滴灵，但是妊娠早期服用灭滴灵有可能引起胎儿畸形，灭滴灵还能够通过胎盘进入胎儿体内，故主张妊娠20周以前均不应服用。

治疗时可采用局部治疗。另外，口服灭滴灵还能从乳汁中排出，哺乳期妇女也不宜使用。