从预防口腔病灶感染的观点来讲，对于所有牙病均应进行治疗，并不在于它是否成为病灶。对于已发生的与口腔病灶有关的疾病（如虹膜炎、睫状体炎、类风湿性关节炎等），都应积极寻找和处理口腔病灶。对于风湿性心脏病、先天性心脏病以及经过瓣膜置换手术的病员，在治疗牙病时，均应慎重行事，采取妥善的预防措施，以免促使口腔病灶感染的扩散，诱发亚急性感染性心内膜炎。
处理口腔病灶并不一定一律采取拔牙的方法，可以应用一切先进的技术，包括处理牙髓病、根尖周病以及牙周病的各种手术或治疗措施。大多数的牙病应用保存疗法也是可以治愈或明显改善的，基本上能达到去除病灶的目的。在处理口腔病灶时应注意采取的措施：①预防性应用抗生素，一般选择青霉素或广谱抗生素。目前多主张术前30分钟一次给予大剂量，因为菌血症的持续时间一般为15分钟左右。也有人主张术后再持续给药24~48小时，不主张长期应用，以免诱发耐药性。这是预防慢性感染病灶扩散，特别是预防亚急性感染性心内膜炎的有效措施。②加强口腔术前术后的消毒。手术操作应力求熟练、轻巧，尽量避免组织损伤。尽量减少损伤面积也是很好的预防措施，每次拔牙不宜过多。软组织切开或行牙龈切除等操作时，采用电刀以减少菌血症及引起心内膜炎的机会。
当消除了口腔病灶后疾病仍不能治愈或无好转时，应考虑是否有口腔以外的病灶，扁桃体、鼻旁窦等均可能是病灶感染源。
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